FOLD.IT-spel - hur spelare hjälper till att bekämpa AIDS

Många tror att dataspel inte ger någon nytta för samhället utan tvärtom skadar. I princip är detta sant, men det finns undantag från alla regler. Till exempel är proteinsyntesemulatorn Foldit för närvarande ett av få spel där du kan bidra till att lösa problemen med att behandla sjukdomar som är obotliga just nu.

Det är svårt att föreställa sig en process inuti vår kropp som skulle äga rum utan att proteiner deltar. I hjärtat av varje cell finns ett protein, inklusive virus och sjukdomsframkallande bakterier. Proteins egenskaper påverkas av dess form och bindningar. Det är på dessa parametrar som vi måste agera. Poängen är att om du viker ett protein till en kompakt form, trots att dess sammansättning inte har förändrats, kommer det inte längre att kunna utföra sina funktioner. Inklusive virusproteiner kommer de inte att kunna attackera vår kropp.

Forskarnas uppgift (och i användarspelet) är att fälla proteinet så kompakt som möjligt. Hur bra du gör det kommer du att förstå utifrån antalet poäng du tjänar. Resultaten av ditt spel kommer att delta i den övergripande online-rankningen och kommer att kunna hjälpa forskare vid behandling av sjukdomar som cancer, aids och många andra dödliga och ännu inte botbara sjukdomar.

Den första lanseringen av ett spelprojekt som heter Fold.it ägde rum i maj 2008 tack vare forskare från University of Washington. Sedan dess har det varit över 240 000 registrerade spelare.

Förutom att förutsäga strukturen för kända proteiner och skapa nya som borde vara lämpliga för de givna målen, erbjöd utvecklarna av Foldit spelare att hjälpa till att skapa algoritmer för automatiskt utförande av dessa uppgifter. Sådana "recept" skapas antingen på ett speciellt skriptspråk eller med hjälp av ett grafiskt gränssnitt. Varje spelare har sin egen "kokbok" med algoritmer. Spelare kan dela "recept" med varandra, förbättra och kombinera andra användares algoritmer.

Varje uppgift publiceras på webbplatsen under en viss period, under vilken användare tävlar med varandra. Det finns också en uppsättning ständigt tillgängliga pussel som är utformade för att bekanta nya användare med Foldits funktioner. Under spelet manipulerar spelare interaktivt molekylen, ändrar huvudramens form och sidogruppernas position, de kan också rotera α-helixer runt sina axlar, ändra budskapet om kedjor i β-strukturer, införa svaga begränsningar i vissa områden. Användaren får information om hur bra han kan vika proteinet i form av punkter.

Övning har visat att det mänskliga sinnets kollektiva tänkande är mycket effektivare än de mest kraftfulla moderna datorerna. Så redan 2011 hjälpte spelarna att dechiffrera kristallstrukturen i apaviruset, det retrovirala proteaset (M-PMV), som orsakar aids hos apor. Pusslet var tillgängligt för spel i bara tre veckor, men dekrypteringen gjordes redan på den tionde dagen, och detta problem förbluffade forskare i 15 år.

Och i januari 2012 slutförde Scientific American-spelare det första projektet för att ändra strukturen på proteinet som fungerar som en katalysator i Diels-Alder-reaktionen, och den nya strukturen som användarna föreslog var mer än 18 gånger mer aktiv än originalet, beräknat av forskare att vara superdatorer.